Bei der Reinigung mit Ozongeneratoren dürfen sich Menschen, Tiere und Pflanzen nicht in den Räumen befinden. Auch nach der Reinigung durch Ozongeneratoren sollten Räume oder Fahrzeuge noch etwa eine Stunde geschlossen bleiben und anschließend ausreichend gelüftet werden, sodass das übrige Ozon entweicht.
Bei der Anwendung ist darauf zu achten, dass die Raumtemperatur unter 30 Grad liegt und die Luftfeuchtigkeit nicht höher als 70 Prozent ist.
Grundsätzlich sollte das Gerät möglichst hoch aufgestellt werden. Ozon ist nämlich schwerer als Luft und drängt somit die Geruchsmoleküle nach oben.

Bei der Reinigung von Wasser, muss das Gerät auf einer höheren Ebene als das Wasser stehen. Dies verhindert, dass Wasser in das Gerät fließen kann.

Zu Ihrer eigenen Sicherheit sollten sie ein Ozongerät immer mit einem Timer betreiben. So schaltet es sich nach einer gewissen Zeit automatisch ab und produziert nicht zu viel Ozon.